Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp8Q80U87 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp8Q80U87 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Usp8Q80U87 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp8Q80U87 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp8Q80U87 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp8Q80U87 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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