Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms