Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms