Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp17leQ7M764 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp17leQ7M764 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp17leQ7M764 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp17leQ7M764 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp17leQ7M764 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp17leQ7M764 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp17leQ7M764 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms