Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TwistnbQ78WZ7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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