Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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