Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Topbp1Q6ZQF0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms