Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms