Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms