Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Krt40Q6IFX3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Krt40Q6IFX3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Krt40Q6IFX3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Krt40Q6IFX3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Krt40Q6IFX3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Krt40Q6IFX3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Krt40Q6IFX3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Krt40Q6IFX3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt40Q6IFX3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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