Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TroQ6DIC6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TroQ6DIC6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TroQ6DIC6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TroQ6DIC6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TroQ6DIC6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TroQ6DIC6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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