Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms