Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2bQ64511 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms