Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift52Q62559 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms