Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sin3bQ62141 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms