Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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