Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms