Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DbpQ60925 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms