Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf3Q60765 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms