Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms