Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3aQ60520 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sin3aQ60520 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms