Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms