Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms