Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTM8

Rnf20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, mousemouse

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Length 973 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf20Q5DTM8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf20Q5DTM8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf20Q5DTM8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf20Q5DTM8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf20Q5DTM8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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