Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ddx49Q4FZF3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ddx49Q4FZF3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx49Q4FZF3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ddx49Q4FZF3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx49Q4FZF3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx49Q4FZF3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ddx49Q4FZF3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ddx49Q4FZF3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx49Q4FZF3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ddx49Q4FZF3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ddx49Q4FZF3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx49Q4FZF3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ddx49Q4FZF3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx49Q4FZF3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ddx49Q4FZF3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx49Q4FZF3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ddx49Q4FZF3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Ddx49Q4FZF3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx49Q4FZF3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx49Q4FZF3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx49Q4FZF3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Ddx49Q4FZF3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx49Q4FZF3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ddx49Q4FZF3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ddx49Q4FZF3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx49Q4FZF3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ddx49Q4FZF3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx49Q4FZF3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx49Q4FZF3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx49Q4FZF3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx49Q4FZF3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx49Q4FZF3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx49Q4FZF3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx49Q4FZF3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx49Q4FZF3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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