Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Snx25Q3ZT31 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Snx25Q3ZT31 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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