Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Krtap9-3Q3V2C1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms