Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms