Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccdc185Q3V118 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc185Q3V118 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc185Q3V118 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc185Q3V118 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc185Q3V118 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc185Q3V118 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccdc185Q3V118 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccdc185Q3V118 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccdc185Q3V118 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc185Q3V118 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccdc185Q3V118 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc185Q3V118 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc185Q3V118 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc185Q3V118 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc185Q3V118 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc185Q3V118 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc185Q3V118 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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