Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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