Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp48Q3V0C5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp48Q3V0C5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp48Q3V0C5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp48Q3V0C5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp48Q3V0C5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp48Q3V0C5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Usp48Q3V0C5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Usp48Q3V0C5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Usp48Q3V0C5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp48Q3V0C5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms