Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms