Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms