Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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