Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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