Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms