Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Tmem253Q3UNB8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Tmem253Q3UNB8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Tmem253Q3UNB8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Tmem253Q3UNB8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmem253Q3UNB8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmem253Q3UNB8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmem253Q3UNB8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmem253Q3UNB8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmem253Q3UNB8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmem253Q3UNB8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmem253Q3UNB8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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