Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hdgfl2Q3UMU9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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