Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b2Q3UJB0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms