Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nkx6-3Q3UHX8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nkx6-3Q3UHX8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nkx6-3Q3UHX8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nkx6-3Q3UHX8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nkx6-3Q3UHX8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nkx6-3Q3UHX8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nkx6-3Q3UHX8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Nkx6-3Q3UHX8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Nkx6-3Q3UHX8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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