Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Parp8Q3UD82 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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