Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms