Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ssbp4Q3U4B1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ssbp4Q3U4B1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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