Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Otud5Q3U2S4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Otud5Q3U2S4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Otud5Q3U2S4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms