Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec24aQ3U2P1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms