Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LcorlQ3U285 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms