Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms