Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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