Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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