Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms